第05章 Pipeline 架构全景

ARS 的核心不是任何一个单独的 Skill，而是 Academic Pipeline——一个 10 阶段的全流程编排器，将 Deep Research（深度研究）、Academic Paper（论文撰写）、Academic Paper Reviewer（论文审查）三个独立技能串联成一个端到端的学术生产管线。

本文从宏观到微观，解析 pipeline 的流程、阶段矩阵、数据访问层级和 Skill 依赖关系。

10 阶段全流程

用户输入
  ↓
Stage 1: RESEARCH      → RQ Brief + 方法论蓝图
  ↓
Stage 2: WRITE         → 大纲 + 初稿
  ↓
Stage 2.5: INTEGRITY   → 7 类失败模式检查（诚信闸门 ①）
  ↓
Stage 3: REVIEW        → 5 位审稿人 + 编辑决定
  ↓
  ├── Accept ──────────────────────→ Stage 4.5
  ├── Minor/Major → Revision Coaching → Stage 4: REVISE
  │                                      ↓
  │                                 Stage 3': RE-REVIEW
  │                                      ↓
  │                                 Stage 4': RE-REVISE（终版）
  │                                      ↓
  └── Reject ──────────────────────→ 结束
  
Stage 4.5: FINAL INTEGRITY → 零容忍重新验证（诚信闸门 ②）
  ↓
Stage 5: FINALIZE       → 格式转换（MD/DOCX/LaTeX/PDF）
  ↓
Stage 6: PROCESS SUMMARY → 过程记录 + AI 自我反思
  ↓
完成

关键设计特征

两条回路：

1. 修订回路（Stage 3 → 4 → 3’ → 4’）：最多 2 轮，硬性限制。Stage 3’ 为 Major 时进入 Residual Coaching → Stage 4’ 后不再允许进一步修订
2. 诚信失败回路（Stage 2.5 FAIL → Stage 2）：最多 3 次重试

不可跳过的闸门：

• Stage 2.5 和 Stage 4.5 的诚信闸门在代码层面是不可绕过的
• 即使你说"跳过"，系统仍然要求你逐条确认检查结果

阶段 × 维度矩阵

每个阶段由特定的 Skill 执行，产出明确的交付物，经过特定的质量闸门后进入下一阶段。

两类用户确认点

Pipeline 中有 10 个人类决策点和 2 个诚信确认点：

决策重点（🧑）— 用户选择分支或确认实质性决定

诚信闸门（✓）— 机器验证先运行，用户确认报告

数据访问层级（v3.3.2+）

ARS 为每个 Skill 标注了 data_access_level，形成三层数据隔离：

raw → redacted → verified_only

User Input (raw data)
    ↓
[deep-research]        data_access_level: raw
    ↓ source_verification 升级
[academic-paper]       data_access_level: redacted
    ↓ Gate 2.5: 7-mode integrity
[academic-paper-reviewer]  data_access_level: verified_only
[academic-pipeline]       data_access_level: verified_only

三层含义：

• raw：消费第一层数据——任意来源（可能是对抗性的）。deep-research 在此层运行，因为它的工作就是从原始 web/PDF/用户查询中提取和验证信息。
• redacted：在被净化的材料上运行，不接收新的原始输入。academic-paper 在此层运行——它消费研究阶段已验证的输出，而非重新搜索。
• verified_only：仅在上游诚信闸门通过后运行。academic-paper-reviewer 和 academic-pipeline 的闸门功能在此层运行——它们审查的是经过验证的论文，而非任意文本。

data_access_level 是声明式标注而非运行时强制执行——它由 CI lint 检查，不检查运行时的 context 窗口。真正的执行点在 Stage 2.5 和 Stage 4.5 的用户审查闸门。

Skill 依赖关系

ARS 的 4 个 Skill 之间存在清晰的依赖图：

deep-research ──→ academic-paper ──→ academic-paper-reviewer
     ↑                  ↑                      ↑
     └──────────────────┴──────────────────────┘
                 academic-pipeline (orchestrates all)

• deep-research 产出研究简报和注释书目，academic-paper 消费这些材料进行论文撰写
• academic-paper 产出完整论文，academic-paper-reviewer 对论文进行多视角审稿
• academic-pipeline 作为编排器，调用上述三个 Skill 并按阶段注入诚信检查、Socratic 指导和协作品质评估

自适应性 Checkpoint（v3.1+）

Pipeline 根据上下文复杂度自动调整 checkpoint 的深度：

• FULL checkpoint：阶段间关键转换点（Stage 1→2、Stage 2→2.5、Stage 3→4）。完整的 5 题自检（引用完整性、谄媚让步、品质轨迹、范围纪律、完整性）+ 可能的上下文重置边界
• SLIM checkpoint：阶段内子步骤。简化确认，但仍需用户明确同意才能推进
• MANDATORY checkpoint：Stage 2.5 和 4.5。不可跳过、不可降级

中途进入机制

Pipeline 不强制从 Stage 1 开始。用户可以直接从中间阶段进入：

"我想做一篇完整的研究论文"    → 从 Stage 1 开始
"我已经有论文，帮我审查"      → 从 Stage 2.5 进入（先做诚信审查）
"我收到审稿意见了"           → 从 Stage 4 进入

中途进入依赖 Material Passport——一份随 pipeline 流转的 Schema 9 文档，记录所有阶段的产出物哈希、合规历史和 checkpoint 决策。

下一篇将逐一介绍 四大技能的核心能力与适用场景。

参考来源：

• source/academic-research-skills/docs/ARCHITECTURE.md
• source/academic-research-skills/shared/ground_truth_isolation_pattern.md
• source/academic-research-skills/academic-pipeline/references/passport_as_reset_boundary.md